Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERFP50548 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERFP50548 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERFP50548 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERFP50548 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERFP50548 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms