Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSNK1EP49674 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSNK1EP49674 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms