Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM23P36406 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms