Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJC1P36383 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJC1P36383 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJC1P36383 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJC1P36383 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GJC1P36383 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJC1P36383 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms