Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCGF2P35227 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms