Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GJA4P35212 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms