Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLIP1P30622 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms