Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRMP28827 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRMP28827 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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