Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ABCD3P28288 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ABCD3P28288 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms