Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4AP27815 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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