Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTX3P26022 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTX3P26022 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTX3P26022 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTX3P26022 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms