Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTSSP25774 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTSSP25774 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms