Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LMNB1P20700 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
LMNB1P20700 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms