Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCNA2P20248 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms