Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATF1P18846 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATF1P18846 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATF1P18846 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATF1P18846 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms