Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PDE6GP18545 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PDE6GP18545 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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