Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPB42P16452 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPB42P16452 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPB42P16452 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPB42P16452 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPB42P16452 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms