Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFAP13804 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFAP13804 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFAP13804 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFAP13804 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFAP13804 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFAP13804 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFAP13804 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ETFAP13804 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms