Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HLA-EP13747 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HLA-EP13747 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms