Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTHFD1P11586 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms