Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBL4AP11441 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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