Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXB7P09629 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXB7P09629 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms