Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
APOA1P02647 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA1P02647 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms