Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR1AO95602 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR1AO95602 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms