Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CLDN9O95484 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLDN9O95484 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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