Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB6O95452 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB6O95452 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB6O95452 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB6O95452 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB6O95452 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB6O95452 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB6O95452 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB6O95452 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms