Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIA3O75145 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPFIA3O75145 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms