Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SCN2BO60939 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN2BO60939 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms