Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NME2P1O60361 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms