Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CXCL13O43927 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CXCL13O43927 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms