Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRS3O43559 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRS3O43559 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRS3O43559 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRS3O43559 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRS3O43559 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms