Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMINO43313 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATMINO43313 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms