Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRTM2O43300 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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