Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PHOX2AO14813 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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