Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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