Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
E9PBE3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
E9PBE3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
E9PBE3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms