Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PATL2C9JE40 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms