Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVV-2B6SEH9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms