Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms