Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A3GALT2U3KPV4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms