Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EMILIN1Q9Y6C2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EMILIN1Q9Y6C2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms