Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms