Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAB39Q9Y376 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms