Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF13BQ9Y275 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFSF13BQ9Y275 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms