Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGSF9BQ9UPX0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGSF9BQ9UPX0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms