Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SMG5Q9UPR3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms