Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN3Q9UPQ7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN3Q9UPQ7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms