Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLEC4AQ9UMR7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLEC4AQ9UMR7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms