Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF2IRD1Q9UHL9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms