Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGXB4Q9UGU5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms